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  • 深圳市艾斯基因科技有限公司
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    張老師

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    全基因組甲基化測序(WGBS)

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    艾斯團隊專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案
    產(chǎn)品介紹

    全基因組甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS),是結合重亞硫酸鹽Bisulfite處理和NGS高通量測序技術(shù),對有參考基因組的物種在全基因組水平進(jìn)行單堿基分辨率的甲基化檢測,適合各種類(lèi)型的樣本(細胞、全血、組織、病理切片、血漿cfDNA等)普遍用于人、動(dòng)物及農林牧漁等方向的高水平甲基化研究。

    用心服務(wù)每一個(gè)項目

    艾斯團隊專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;

    已經(jīng)完成人、動(dòng)植物等幾十個(gè)物種, 5000+例樣本W(wǎng)GBS項目經(jīng)驗;

    已完成常規樣本、復雜樣本(FFPE)及微量樣本(血漿cfDNA)多種樣本類(lèi)型項目;

    嚴格WGBS建庫質(zhì)控和效率,Bisulfite轉化率>99%;

    自動(dòng)化建庫測序流程,保障WGBS周期交付能力;

    重點(diǎn)團隊發(fā)表Genome Biol、Nat Commun、Cell Res等高水平SCI文章;

    專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。

    科學(xué)方案設計

    從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;

    每個(gè)項目需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果

    樣本類(lèi)型和要求

    樣本類(lèi)型

    樣本要求

    基因組DNA

    總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

    血漿/血清/cfDNA

    建議提供1-4ml血漿/血清, 或者>15ng cfDNA

    細胞、全血、動(dòng)植物組織等

    按照送樣要求準備

    備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

    信息分析

    WGBS

    分析內容

    備注

    標準分析

    1、測序數據質(zhì)量評估

    過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量

    2、與參考基因組比對

    比對率和覆蓋度分析

    3、甲基化位點(diǎn)Calling

    評估胞嘧啶甲基化狀態(tài)

    4、甲基化分布圖譜分析

    甲基化在基因組、功能元件上的分布

    5、組間差異甲基化DMR分析

    尋找DMR及注釋

    6、差異甲基化基因DMG分析

    DMG富集分析GO,KEGG

    7、多樣本聚類(lèi)分析

    PCA分析多樣本甲基化變化規律

    高級分析

    8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

    例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析

    9、其它定制化分析

    結合課題背景亮點(diǎn)挖掘

    全基因組甲基化測序(WGBS)
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    已完成常規樣本、復雜樣本(FFPE)及微量樣本(血漿cfDNA)多種樣本類(lèi)型項目;

    嚴格WGBS建庫質(zhì)控和效率,Bisulfite轉化率>99%;

    自動(dòng)化建庫測序流程,保障WGBS周期交付能力;

    重點(diǎn)團隊發(fā)表Genome Biol、Nat Commun、Cell Res等高水平SCI文章;

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    樣本要求

    基因組DNA

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    血漿/血清/cfDNA

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    WGBS

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    1、測序數據質(zhì)量評估

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    甲基化在基因組、功能元件上的分布

    5、組間差異甲基化DMR分析

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    6、差異甲基化基因DMG分析

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