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  • 深圳市艾斯基因科技有限公司
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    DNA 6mA免疫沉淀測序 (6mA-IP Seq)

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    6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過(guò)特異性抗體富集6mA甲基化的DNA片段,結合NGS測序技術(shù)在全基因組水平上分析6mA修飾信息。
    產(chǎn)品介紹

    DNA 6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)

    N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類(lèi)型之一,

    在細菌、藻類(lèi)及植物基因組中普遍存在,在DNA錯配修復、染色體分離和毒力調節中發(fā)揮作用。

    6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過(guò)特異性抗體富集6mA甲基化的DNA片段,結合NGS測序技術(shù)在全基因組水平上分析6mA修飾信息。

    用心服務(wù)每一個(gè)項目

    專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;

    國內較早開(kāi)發(fā)6mA-seq技術(shù)團隊之一, 嚴格的內參質(zhì)控;

    已經(jīng)完成藻類(lèi)及動(dòng)植物及人等多個(gè)物種6mA-seq項目經(jīng)驗;

    專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。

    科學(xué)方案設計

    從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;

    每個(gè)項目需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。

    樣本類(lèi)型和要求

    樣本類(lèi)型

    樣本要求

    基因組DNA

    總量≥ 5ug; 濃度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量

    動(dòng)植物、藻類(lèi)、低等生物等

    按照送樣要求準備

    備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

    數據分析

    6mA-IP Seq

    分析內容

    備注

    標準分析

    1、測序數據質(zhì)量評估

    過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量

    2、與參考基因組比對

    測序Reads 在基因組上的分布

    3、6mAPeak峰Calling

    6mADNA富集區域鑒定

    4、6mAPeak圖譜分析

    6mAPeak在基因組,染色體,功能元件上的分布

    6、組間差異6mAPeak分析

    尋找6mADMR及注釋

    7、差異6mAPeak基因分析

    相關(guān)基因GO,KEGG富集分析

    高級分析

    8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

    例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析

    9、其它定制化分析

    結合課題背景亮點(diǎn)挖掘

    DNA 6mA免疫沉淀測序 (6mA-IP Seq)
    DNA 6mA免疫沉淀測序 (6mA-IP Seq)

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    在細菌、藻類(lèi)及植物基因組中普遍存在,在DNA錯配修復、染色體分離和毒力調節中發(fā)揮作用。

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    樣本要求

    基因組DNA

    總量≥ 5ug; 濃度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量

    動(dòng)植物、藻類(lèi)、低等生物等

    按照送樣要求準備

    備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

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    6mA-IP Seq

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    備注

    標準分析

    1、測序數據質(zhì)量評估

    過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量

    2、與參考基因組比對

    測序Reads 在基因組上的分布

    3、6mAPeak峰Calling

    6mADNA富集區域鑒定

    4、6mAPeak圖譜分析

    6mAPeak在基因組,染色體,功能元件上的分布

    6、組間差異6mAPeak分析

    尋找6mADMR及注釋

    7、差異6mAPeak基因分析

    相關(guān)基因GO,KEGG富集分析

    高級分析

    8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

    例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析

    9、其它定制化分析

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