DNA 6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)
N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類(lèi)型之一,
在細菌、藻類(lèi)及植物基因組中普遍存在,在DNA錯配修復、染色體分離和毒力調節中發(fā)揮作用。
6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過(guò)特異性抗體富集6mA甲基化的DNA片段,結合NGS測序技術(shù)在全基因組水平上分析6mA修飾信息。
用心服務(wù)每一個(gè)項目
專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;
國內較早開(kāi)發(fā)6mA-seq技術(shù)團隊之一, 嚴格的內參質(zhì)控;
已經(jīng)完成藻類(lèi)及動(dòng)植物及人等多個(gè)物種6mA-seq項目經(jīng)驗;
專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。
科學(xué)方案設計
從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;
每個(gè)項目需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。
樣本類(lèi)型和要求
樣本類(lèi)型 | 樣本要求 |
基因組DNA | 總量≥ 5ug; 濃度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量 |
動(dòng)植物、藻類(lèi)、低等生物等 | 按照送樣要求準備 |
備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸 |
數據分析
6mA-IP Seq | 分析內容 | 備注 |
標準分析 | 1、測序數據質(zhì)量評估 | 過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量 |
2、與參考基因組比對 | 測序Reads 在基因組上的分布 | |
3、6mAPeak峰Calling | 6mADNA富集區域鑒定 | |
4、6mAPeak圖譜分析 | 6mAPeak在基因組,染色體,功能元件上的分布 | |
6、組間差異6mAPeak分析 | 尋找6mADMR及注釋 | |
7、差異6mAPeak基因分析 | 相關(guān)基因GO,KEGG富集分析 | |
高級分析 | 8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析 | 例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析 |
9、其它定制化分析 | 結合課題背景亮點(diǎn)挖掘 |
DNA 6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)
N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類(lèi)型之一,
在細菌、藻類(lèi)及植物基因組中普遍存在,在DNA錯配修復、染色體分離和毒力調節中發(fā)揮作用。
6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過(guò)特異性抗體富集6mA甲基化的DNA片段,結合NGS測序技術(shù)在全基因組水平上分析6mA修飾信息。
用心服務(wù)每一個(gè)項目
專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;
國內較早開(kāi)發(fā)6mA-seq技術(shù)團隊之一, 嚴格的內參質(zhì)控;
已經(jīng)完成藻類(lèi)及動(dòng)植物及人等多個(gè)物種6mA-seq項目經(jīng)驗;
專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。
科學(xué)方案設計
從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;
每個(gè)項目需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。
樣本類(lèi)型和要求
樣本類(lèi)型 | 樣本要求 |
基因組DNA | 總量≥ 5ug; 濃度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量 |
動(dòng)植物、藻類(lèi)、低等生物等 | 按照送樣要求準備 |
備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸 |
數據分析
6mA-IP Seq | 分析內容 | 備注 |
標準分析 | 1、測序數據質(zhì)量評估 | 過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量 |
2、與參考基因組比對 | 測序Reads 在基因組上的分布 | |
3、6mAPeak峰Calling | 6mADNA富集區域鑒定 | |
4、6mAPeak圖譜分析 | 6mAPeak在基因組,染色體,功能元件上的分布 | |
6、組間差異6mAPeak分析 | 尋找6mADMR及注釋 | |
7、差異6mAPeak基因分析 | 相關(guān)基因GO,KEGG富集分析 | |
高級分析 | 8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析 | 例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析 |
9、其它定制化分析 | 結合課題背景亮點(diǎn)挖掘 |
在線(xiàn)留言
相關(guān)產(chǎn)品
復制成功
×