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  • 深圳市艾斯基因科技有限公司
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    0755-28507994
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    張老師

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    簡(jiǎn)化基因組甲基化測序 (RRBS)

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    簡(jiǎn)化基因組甲基化測序 (RRBS)通過(guò)酶切富集啟動(dòng)子及CpG 島區域,并進(jìn)行Bisulfite 測序
    產(chǎn)品介紹

    簡(jiǎn)化甲基化測序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),

    通過(guò)酶切富集啟動(dòng)子及CpG 島區域,并進(jìn)行Bisulfite 測序;

    作為高性?xún)r(jià)比的甲基化研究方法,RRBS在大規模臨床樣本的研究中具有普遍的應用;

    在經(jīng)典RRBS基礎上,艾斯基因在國內較早推出強化版 RRBS,助力全基因組甲基化測序,

    可覆蓋全基因組范圍內超過(guò)6-9M個(gè)CpG 位點(diǎn),>90%數量的CpG島及>85%數量的基因啟動(dòng)子。

    重點(diǎn)技術(shù)質(zhì)控,用心服務(wù)每一個(gè)項目

    艾斯團隊專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;

    較早開(kāi)發(fā)RRBS技術(shù)團隊之一, 國內較早推出強化版RRBS服務(wù);

    已經(jīng)完成人、哺乳動(dòng)物及魚(yú)類(lèi)等多個(gè)物種, 10000+例樣本項目經(jīng)驗;

    嚴格的RRBS技術(shù)質(zhì)控,MSPI酶切率>95%, Bisulfite轉化率>99%;

    自動(dòng)化樣本處理、建庫及分析流程,保障高效周期,40天極速交付;

    低至10ng建庫,滿(mǎn)足穿刺、流式分選、微切等微量珍貴樣本的研究;

    重點(diǎn)團隊在Nature、Epigenetics、DNA Res等雜志發(fā)表多篇SCI論文;

    專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。

    科學(xué)方案設計

    從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;

    每個(gè)項目需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。

    樣本類(lèi)型和要求

    樣本類(lèi)型

    樣本要求

    基因組DNA

    總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 完整性好; 基于Qubit定量

    細胞、全血、動(dòng)物新鮮冷凍組織

    按照送樣要求準備

    備注1:不推薦FFPE、cfDNA等片段化樣本類(lèi)型;

    備注2:不適合植物物種;

    備注2用封口膜密封樣品; 干冰運輸

    數據分析

    RRBS

    分析內容

    備注

    標準分析

    1、測序數據質(zhì)量評估

    過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量

    2、與參考基因組比對

    比對率和覆蓋度分析

    3、MSPI酶切及Bisulfite轉化率質(zhì)控

    MSPI酶切效率>95%; Bisulfite轉化率>99%

    4、甲基化位點(diǎn)Calling

    評估胞嘧啶甲基化狀態(tài)

    5、甲基化分布圖譜分析

    甲基化在基因組、功能元件上的分布

    6、組間差異甲基化DMR分析

    尋找DMR及注釋

    7、差異甲基化基因DMG分析

    DMG富集分析GO,KEGG

    8、多樣本聚類(lèi)分析

    PCA分析多樣本甲基化變化規律

    高級分析

    9、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

    例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析

    10、其它定制化分析

    結合課題背景亮點(diǎn)挖掘


    簡(jiǎn)化基因組甲基化測序 (RRBS)
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    作為高性?xún)r(jià)比的甲基化研究方法,RRBS在大規模臨床樣本的研究中具有普遍的應用;

    在經(jīng)典RRBS基礎上,艾斯基因在國內較早推出強化版 RRBS,助力全基因組甲基化測序,

    可覆蓋全基因組范圍內超過(guò)6-9M個(gè)CpG 位點(diǎn),>90%數量的CpG島及>85%數量的基因啟動(dòng)子。

    重點(diǎn)技術(shù)質(zhì)控,用心服務(wù)每一個(gè)項目

    艾斯團隊專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;

    較早開(kāi)發(fā)RRBS技術(shù)團隊之一, 國內較早推出強化版RRBS服務(wù);

    已經(jīng)完成人、哺乳動(dòng)物及魚(yú)類(lèi)等多個(gè)物種, 10000+例樣本項目經(jīng)驗;

    嚴格的RRBS技術(shù)質(zhì)控,MSPI酶切率>95%, Bisulfite轉化率>99%;

    自動(dòng)化樣本處理、建庫及分析流程,保障高效周期,40天極速交付;

    低至10ng建庫,滿(mǎn)足穿刺、流式分選、微切等微量珍貴樣本的研究;

    重點(diǎn)團隊在Nature、Epigenetics、DNA Res等雜志發(fā)表多篇SCI論文;

    專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。

    科學(xué)方案設計

    從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;

    每個(gè)項目需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。

    樣本類(lèi)型和要求

    樣本類(lèi)型

    樣本要求

    基因組DNA

    總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 完整性好; 基于Qubit定量

    細胞、全血、動(dòng)物新鮮冷凍組織

    按照送樣要求準備

    備注1:不推薦FFPE、cfDNA等片段化樣本類(lèi)型;

    備注2:不適合植物物種;

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    數據分析

    RRBS

    分析內容

    備注

    標準分析

    1、測序數據質(zhì)量評估

    過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量

    2、與參考基因組比對

    比對率和覆蓋度分析

    3、MSPI酶切及Bisulfite轉化率質(zhì)控

    MSPI酶切效率>95%; Bisulfite轉化率>99%

    4、甲基化位點(diǎn)Calling

    評估胞嘧啶甲基化狀態(tài)

    5、甲基化分布圖譜分析

    甲基化在基因組、功能元件上的分布

    6、組間差異甲基化DMR分析

    尋找DMR及注釋

    7、差異甲基化基因DMG分析

    DMG富集分析GO,KEGG

    8、多樣本聚類(lèi)分析

    PCA分析多樣本甲基化變化規律

    高級分析

    9、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

    例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析

    10、其它定制化分析

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