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可廣泛應用于羥甲基化與疾病關(guān)系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過(guò)程中的研究產(chǎn)品介紹羥甲基化DNA免疫沉淀測序(Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Sequencing，hMeDIP-Seq)，
是通過(guò)5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DNA片段，結合NGS測序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數據量，快速、高效地尋找羥甲基化區域;
可廣泛應用于羥甲基化與疾病關(guān)系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過(guò)程中的研究。
重點(diǎn)技術(shù)及質(zhì)控，用心服務(wù)每一個(gè)項目
專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年，提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA羥甲基化完整解決方案;
較早開(kāi)發(fā)羥甲基化測序技術(shù)的團隊，提供羥甲基化多種解決方案;
已完成人、小鼠、獼猴等多種物種的hMeDIP-seq項目經(jīng)驗;
助力客戶(hù)在Clin Epigenetics等雜志發(fā)表多篇論文;
專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。
科學(xué)方案設計
從項目方案、樣本處理、建庫測序，到數據分析;
每個(gè)項目需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通，以保障高質(zhì)量研究成果。
樣本類(lèi)型和要求
樣本類(lèi)型
樣本要求
基因組DNA
總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
細胞、全血、動(dòng)物組織等
按照送樣要求準備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運輸
數據分析
hMeDIP-seq
分析內容
備注
標準分析
1、測序數據質(zhì)量評估
過(guò)濾掉低質(zhì)量數據，保證數據質(zhì)量
2、與參考基因組比對
測序Reads 在基因組上的分布
3、5hmC Peak峰Calling
5hmC富集區域鑒定
4、5hmCPeak圖譜分析
5hmCPeak在基因組，染色體，功能元件上的分布
6、組間差異5hmCPeak分析
尋找DhMR及注釋
7、差異5hmCPeak基因分析
相關(guān)基因GO，KEGG富集分析
高級分析
8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析
例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析
9、其它定制化分析
結合課題背景亮點(diǎn)挖掘
產(chǎn)品介紹羥甲基化DNA免疫沉淀測序(Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Sequencing，hMeDIP-Seq)，
是通過(guò)5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DNA片段，結合NGS測序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數據量，快速、高效地尋找羥甲基化區域;
可廣泛應用于羥甲基化與疾病關(guān)系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過(guò)程中的研究。
重點(diǎn)技術(shù)及質(zhì)控，用心服務(wù)每一個(gè)項目
專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年，提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA羥甲基化完整解決方案;
較早開(kāi)發(fā)羥甲基化測序技術(shù)的團隊，提供羥甲基化多種解決方案;
已完成人、小鼠、獼猴等多種物種的hMeDIP-seq項目經(jīng)驗;
助力客戶(hù)在Clin Epigenetics等雜志發(fā)表多篇論文;
專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。
科學(xué)方案設計
從項目方案、樣本處理、建庫測序，到數據分析;
每個(gè)項目需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通，以保障高質(zhì)量研究成果。
樣本類(lèi)型和要求
樣本類(lèi)型
樣本要求
基因組DNA
總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
細胞、全血、動(dòng)物組織等
按照送樣要求準備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運輸
數據分析
hMeDIP-seq
分析內容
備注
標準分析
1、測序數據質(zhì)量評估
過(guò)濾掉低質(zhì)量數據，保證數據質(zhì)量
2、與參考基因組比對
測序Reads 在基因組上的分布
3、5hmC Peak峰Calling
5hmC富集區域鑒定
4、5hmCPeak圖譜分析
5hmCPeak在基因組，染色體，功能元件上的分布
6、組間差異5hmCPeak分析
尋找DhMR及注釋
7、差異5hmCPeak基因分析
相關(guān)基因GO，KEGG富集分析
高級分析
8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析
例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析
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